安徽中医学院图书馆成立于1959年，2000年，原安徽省医药学校图书馆并入。该馆收藏古籍26030册，其中善本古籍3364册。《医说》、《备急千金要方》、《婴童百问》等中医古籍是其特色藏品。入选第一、三批《国家珍贵古籍名录》4部。该馆有古籍专用书库2个，总面积234 平方米。古籍部人员5人，2005年成立古籍修复室，开展古籍修复工作。