西藏档案馆所藏古籍主要来自于平定1959年叛乱后，从原西藏地方政府各部门和参加叛乱的拉萨地区及其附近的寺庙、贵族家里连同西藏历史档案一起接收而来。古籍藏量达4276函，195370册。其中善本藏量达4000函，182760册。此外还收藏有98000块刻板。据初步鉴定，绝大多数为明代、清代及民国时期，收藏古籍版本多为刻本和写本，梵夹装为主，部分古籍为朱砂、金、银、宝石等珍贵材料书写而成。大部分为纸质，尚有贝叶经等。文种多为藏文，其他还有蒙文、梵文等。内容广泛，包含政治、经济、建筑学、绘画、音乐、西藏医学、天文历算、高僧大德文集、佛教典籍等等。且保存状况比较好。档案馆单独设立两个古籍特藏书库，面积364平方米。古籍阅览室一个，面积50平方米。