文明古籍特藏保护囿于财力、人力等因素，书库条件较差，多数文献使用的是开敞式木书架，缺少空调、除湿设施，因此很难满足古籍在防虫、防霉、防潮、防热、防尘以及老化、破损等方面的要求。近年来在省委省政府的重视下，在省文化厅的领导下，实施了文化保护工程，加大了财力投入，建造了新馆，对老楼(图一、图二、图三)进行了全面整修，添置了大量空调机、除湿机（图四），将旧书架、书箱全部更换成樟木书橱、书箱(图五、图六)，仅书箱、书橱一项就投入300余万元，使藏书条件得到了极大改善。古籍修复方面，待修书数以万册计，需修数百年。现馆部正在加大人力物力的投入。古籍修复人员正式职工有4人，临时工有6人。 2006年专项投入20万，计划修补古籍7.5万叶。古籍修复和保护工作还需加大投入，并将是一项长期的重点工作。

文明改革开放以来，藏书建设方面增藏了《四库全书》、《续修四库全书》、《四库全书存目丛书》、《四库未收书辑刊》、《中华再造善本》、《敦煌宝藏》等大型影印古籍，又购藏了5000余册古旧家谱，使馆藏古文献品种大幅度增加。同时，本馆也积极整理和开发文献，四库系列等项目共计出版馆藏 200余种，其中《浙江图书馆古籍善本书目》荣获省社会科学类二等奖。